Научный Open Source Опции

[Гость_Nils_*]

Тут будем рассказывать об Научном Open Source.


Scientific Linux

Пара скриншотов

SL - это релиз Linux, который создан совместными усилиями Fermilab и CERN при поддержке различных лабораторий и университетов со всего мира. Его исходной целью было стремление уменьшить дублирование усилий лабораторий и иметь общую инсталляционную базу для различных экспериментов.

Scientific Linux - официальный сайт (SL)


Полезные ссылки
Обзор свободных программ для численных расчётов

[Nils]

UGENE 1.6.0

UGENE — это свободное ПО для работы молекулярного биолога.

Основные возможности:
* Множественное выравнивание последовательностей на основе MUSCLE 3 и MUSCLE 4;
* Анализ с помощью скрытых марковских моделей, основанный на HMMER 2 и HMMER 3;
* Дизайн ПЦР-праймеров с помощью Primer 3;
* Предсказание вторичной структуры белков с помощью GOR IV и PSIPRED;
* Филогенетический анализ с помощью Phylip;
* Поиск сайтов рестрикции;
* Сверхбыстрый поиск простых и тандемных повторов;
* Анализ сайтов связывания транскрипционных факторов на основе SITECON;
* Поиск открытых рамок считывания;
* Выравнивание последовательностей с помощью алгоритма Смита-Ватермана.

Сайт проекта