Научный Open Source Опции

[Гость_Nils_*]

Тут будем рассказывать об Научном Open Source.


Scientific Linux

Пара скриншотов

SL - это релиз Linux, который создан совместными усилиями Fermilab и CERN при поддержке различных лабораторий и университетов со всего мира. Его исходной целью было стремление уменьшить дублирование усилий лабораторий и иметь общую инсталляционную базу для различных экспериментов.

Scientific Linux - официальный сайт (SL)


Полезные ссылки
Обзор свободных программ для численных расчётов

[metelev_sv]

CCP14
"The Collaborative Computational Projects (CCPs), assist universities in developing, maintaining, promoting and distributing computer programs and computational methods."

Сайт: http://www.ccp14.ac.uk

Я не специалист по диффракции, просто прослушал обзор и хочу поделиться. Поэтому комментарии мои будут коротки и поправки можно вносить смело.

Аннотация сайта (в моём переводе):
CCP14 (совместный вычислительный проект номер 14) в области диффракции на порошках и низкомолекулярных монокристаллах был инициирован в 1994 году для сбора лучших и наиболее широко используемых программ. Программное обеспечение расположенное на сайте CCP14 может бесплатно использоваться в научных целях.

В нескольких обзорах программного обеспечения, сделанных между 1991 и 1993 годами подчёркивалась необходимость создания набора программ для выполнения стандартных задач рентгеновской порошковой диффракции. Доктор J. I. Langford из Университета Бирмингема вместе с доктором R. J. Cernik и доктором P. J. Durham из лаборатории в Дерзбери подали пропоузал (заявку на финансирование) в S.E.R.C., с целью создания совместного вычислительного проекта. Заявка была одобрена в июне 1993 года. Система CCP служит для развития сотрудничества между различными университетами в вычислительных и теоретических исследованиях во всём разнообразии областей знания связанных с физикой, химией, биохимией и кристаллографией. Каждым из CCP проектов руководит управляющий комитет, который в свою очередь подчиняется совету экспертов (это я так понял слова Steering Panel). Цели проекта CCP14, который охватывает области порошковой и монокристалльной диффракции были определены следующим образом:

• Разработка набора совместимых друг с другом программ с дружественным интерфейсам для сообщества людей работающих в области порошковой и монокристалльной диффракции
• организации встреч (обсуждений, наверное)
• создания рабочих групп, определения приоритетных направлений, распостранения информации и предоставления отчётов совету экспертов.

На сайте есть ссылки на множество программ, особое внимание стоит обратить на программы:

• powder cell --- программа для генерации диффракционной кривой, для этого требуется задать структуру соединения, просто по атомам, какой где.
• fit2d --- при наличии двумерной картинки с диффракционными кольцами позволяет уточнить какие-то из параметров 1) расстояние образец-детектор 2) длина волны излучения 3) центрировку, наверное что-то ещё забыл. И позволяет построить линейную картину.
• Fullprof и графический интерфейс к ней winplotr. --- по диффракционной картине позволяет восстановить или уточнить структуру, использует идеологию предложенную Ритвельдом.

Это набор, который принято использовать в Европе для анализа порошковых диффракционных данных. Как правило, можно работать не только с рентгеновскими, но и с нейтронными данными. Остальные программы из списка либо используются другими научными сообществами либо разработаны для монокристаллов либо ещё зачем-нибудь, о чём я не знаю.

А ещё, на всякий случай скажу, на гигапедии лежат международные кристаллографические таблицы, 8 или 9 томов---наверное все, которые есть.