Научный Open Source Опции

[Гость_Nils_*]

Тут будем рассказывать об Научном Open Source.


Scientific Linux

Пара скриншотов

SL - это релиз Linux, который создан совместными усилиями Fermilab и CERN при поддержке различных лабораторий и университетов со всего мира. Его исходной целью было стремление уменьшить дублирование усилий лабораторий и иметь общую инсталляционную базу для различных экспериментов.

Scientific Linux - официальный сайт (SL)


Полезные ссылки
Обзор свободных программ для численных расчётов

[Nils]

Scisoft 7.5

Linux для астрономов на базе Fedora 11

На сайте Южной европейской обсерватории

Data Analysis Systems

IRAF 2.14-1
ctio - Utilities from CTIO
gemini 1.9 - Utilities from the Gemini Telescopes
gmisc - Miscellaneous utilities for Gemini
mxtools (Dec2001) - Utilities from NOAO including QDPHOT
guiapps - Graphical applications for IRAF
xdimsum (Jan2003) - Enhanced IR data reduction and mosaicing software
ifocas (Apr2001) - Enhanced object detection and classification software
dimsum 3.0 (Aug2002) - IR data reduction and mosaicing software
color - Utilities for creating colour images
fitsutil - FITS utilities
mscred 4.8 (May 2004) - Mosaic camera CCD reduction tasks from NOAO
esowfi 1.3 (Mar2001)
eis 1.8 (May2002) - ESO Imaging Survey IRAF tasks (EIS Drizzle etc)
rvsao 2.7.8 - Spectral Radial Velocity package from CfA - Updated in Scisoft 7.5
nmisc 020618 - IRAF miscellany
xccdred - CCD reduction for multi-port chips
stecf 1.5 - Utilities from ST-ECF, including polarimetry reduction and spectral restoration packages
STSDAS/TABLES 3.12 - HST data analysis and tables systems - Updated in Scisoft 7.5
ECL - Enhanced CL
Eclipse 5.0 - Includes ISAAC, CONICA, WFI, Lua and ADONIS add-ons
ESO-MIDAS 09Sep pl1.2 - Updated in Scisoft 7.5
PyMidas 1.0.5
IDL 7.1 - Interactive Data Language from RSI. Commercial package, requires license - Note: NOT included in EXPORT version
Astron (April 2010) - Goddard Astron IDL astronomical procedure library - Updated in Scisoft 7.5
StarFinder - IDL adaptive optics photometry software
JHUAPL Library (Aug2004) - IDL procedure collection from Johns Hopkins
ATV - an interactive display tool for IDL
Gildas (May09d) - Radio astronomy applications from IRAM
Difmap 2.4j - Interactive program for radio synthesis imaging from Caltech
Miriad 3.1 Calibration, mapping, deconvolution and image analysis of interferometric data
Karma 1.7 - Toolkit for interprocess communications, authentication, encryption, graphics display, user interface and manipulating the Karma network data structure
MiniCRUSH 1.05-3 - A minimalistic version of CRUSH for LABOCA & ASZCA - Updated in Scisoft 7.5
BoA - Bolometer Array Analysis Software - Updated in Scisoft 7.5


Image Display Servers

x11iraf 1.3.1 - May 2000 version, including xgterm (but excluding ximtool)
SAOImage 1.35.1 - The original, needs 8bit Xserver
DS9 6.0 - Latest display server from SAO. Works with 24bit X servers - Updated in Scisoft 7.5
XPA 2.1.7b2 - Messaging system from SAO. Used by DS9.
Skycat 3.0.1 - ESO image display tool with catalogue and image server access
fv 5.3
QFitsView 2.0 Rev 400 - FITS file viewer
Gaia 4.2.2 - Graphical Astronomy and Image Analysis Tool


Graphics Software

SM 2.4.26 (Dec2002) - SuperMongo - Note: NOT included in EXPORT version
PGPLOT 5.2 - Graphics library
gnuplot 4.2.3 - Command-line driven interactive function plotting utility
Grace 5.1.9 - 2D WYSIWYG plotting tool
ggobi 2.1.8 - Data visualisation in 3D
Matplotlib 0.99 - Python 2D plotting library
PLplot 5.9.4 - Cross-platform software package for creating scientific plots.


Scripting Languages

Python 2.5.4 - General purpose, object orientated, extensible scripting language
Numeric 24.2
Scientific 2.4.9
RV 1.1
Imaging (PIL) 1.1.4
Pmw 1.2
pcfitsio 0.99.2
_sre readline _locale thread zlib fcntl pwd grp errno select mmap _socket termios _tkinter
asciidata 1.1.1
binascii
ipython 0.9.1
scipy 0.7.1
Gnuplot 1.7
ppgplot 1.3
biggles 1.6.4
psyco 1.4
pygame 1.7.1
cStringIO & cPickle
wx 2.8.8.1 (wxPython)
healpy 0.9.2
STScI_Python 2.9 - STScI Python packages, - Updated in Scisoft 7.5 including the following:
PyRAF 1.9.0 - Python replacement for IRAF cl
numarray 1.5.2 - Enhanced Python numerical package from STScI
PyFITS 2.3.1 - Python FITS package from STScI
PyDrizzle 6.3.5 - Drizzling software
MultiDrizzle 3.3.7 - Automatic image combination drizzling software
NumPy 1.3.0 - Python package for scientific computing
Java 1.6.0_20 - Java runtime environment and JDK - Updated in Scisoft 7.5
DPUser 2.0 Rev 400 - Interactive language for handling numbers, strings, and matrices


Scientific Libraries

GSL 1.9 - The GNU Scientific Library
DISLIN 9.1 - Scientific Data Plotting software
CFITSIO 3.24 - FITS File Subroutine Library - Updated in Scisoft 7.5
LAPACK Release 3.1.1 - Linear Algebra Subroutine Library
Atlas 3.8.3 - Another Linear Algebra Library
FFTW 3.2.2 - Fast Fourier Transform library - Updated in Scisoft 7.5
plotutils 2.5 - GNU plotting utilities
JPype 0.5.2.2 - Java to Python integration
Funtools 1.4.0 - "Minimal buy-in" FITS library and utility package


Miscellaneous Utilities

wcstools 3.8.1 - World Coordinate System software tools and library from Doug Mink at SAO- Updated in Scisoft 7.5
Astromatic Software Tools SExtractor 2.5.0, SWarp 2.17.6, SCAMP 1.7.0, EyE 1.4.1, MissFits 2.2.11, SkyMaker 3.3.3, STIFF 2.1.2, Stuff 1.19 & WeightWatcher 1.8.10
Tiny Tim 7.0 (June 2008 - including WFC3) - HST point-spread function simulation software
Xephem 3.7.2 - Planetarium and ephemeris software
dss & dss2 - Digitized Sky Survey image extraction software
Cloudy 06.01 - Plasma simulation and spectral synthesis code (no patches applied)
HyperZ 1.1 - Photometric Redshift Code
Latex style files - A collection of style files for astronomical journals
DAOPhot - Stellar Photometry and related packages from Peter Stetson at DAO/HIA, see agreement for redistribution or access to the source code
fitsverify - FITS format checker
fitscut - Image cutout and conversion utility
graphviz 2.20.2 - Graph Visualisation Software
fpack and funpack 1.4.1 - FITS file compression utilities - Updated in Scisoft 7.5


Virtual Observatory Tools [see FAQ entry]

Aladin - Aladin Sky Atlas
VOspec - tool for handling Virtual Observatory compliant Spectra
VOplot - VOTable plotting tool
Plastic - PLatform for AStronomical Tool InterConnection
Specview
Splat - Spectral Analysis Tool
Stilts - Starlink Tables Infrastructure Library Tool Set
TOPCAT - Tool for OPerations on Catalogues And Tables
VirGO - Visual Browser for the ESO Science Archive Facility
VisIVO - Visualisation Interface to the VO

[Wild Bill]

Некоторой баг... Установил Gnuplot 4.4 на Win7 x64, запускается, но графическое окно вешает программу. Конечно, Gnupolt -- x32, но другого я не видел. (IMG:style_emoticons/default/sad.gif)

[Const]

Некоторой баг... Установил Gnuplot 4.4 на Win7 x64, запускается, но графическое окно вешает программу. Конечно, Gnupolt -- x32, но другого я не видел. (IMG:style_emoticons/default/sad.gif)

Извиняюсь, что поздно заметил.
Так оно-ж в исходных кодах идёт. Собрать в x64 окружении не пробовали?

[Wild Bill]

(Извинений точно не стоит...(IMG:style_emoticons/default/smile.gif) )
Нет... не собирал под Винды, слишком много надо устанавливать дополнительно. Пользую сейчас под Linux, всё нормально. (IMG:style_emoticons/default/smile.gif)
А под Вин 7 у меня вдруг и ParaView стал глючить... и сервиспак не ставится... Хотел купить лицензионный, но продавец сказал, что и у того эти проблемы есть. (IMG:style_emoticons/default/sad.gif)

[Const]

(Извинений точно не стоит...(IMG:style_emoticons/default/smile.gif) )
Нет... не собирал под Винды, слишком много надо устанавливать дополнительно. Пользую сейчас под Linux, всё нормально. (IMG:style_emoticons/default/smile.gif)
А под Вин 7 у меня вдруг и ParaView стал глючить... и сервиспак не ставится... Хотел купить лицензионный, но продавец сказал, что и у того эти проблемы есть. (IMG:style_emoticons/default/sad.gif)

Так ParaView, вроде, свободный?
По крайней мере код они отдают, и в моём дистрибутиве он есть.
Вот кстати, одно из преимуществ Linux: научный OpenSource в большинстве дистрибутивов присутствует и ставится одной командой.