ChemOffice это вообще-то не программа - а набор программ, ChemDraw - рисовать 2-мерные структуры, Chem3D - трехмерные + оптимизация геометрии, E-Notebook - вести лабжурналы, ну и ChemFinder для создания баз данных.
Книг по этому ПО официальных нет, неофициальных тоже в первом приближении увидеть не удалось. Можете попробвать переводчик от google, чтобы перевести требуемый help.

Боюсь, что нет. Уширение полос в ИК-спектроскопии связано с разбросом силовых постоянных, который в свою очередь возникает из-за того, что мы опять же имеем не единичную молекулу в вакууме, а какую-то смесь как правило в конденсированной фазе. Вспомните, к примеру шииирокий хвостище в области 3000-4000 см(-1) для недосушенных препаративных образцов различных - это водородные связи. Там, где воды нет - в этой области образец прозрачен. Точно также и с другими полосами - если образец был прессован в KBr например, то карбонильная полоса и чуть более низкие по частоте довольно широки, в вазелиновом масле - структура спектра же - более тонкая.
Кроме того, разрешающая способность прибора тоже играет важную роль. Когда у Вас прибор, например, bruker alpha - и разрешение 4 см(-1) это одно - спектрики будут грубые, и полосы широкие, а на varian 640-ir с разрешением 0.18 см(-1) - тонкая структура будет хорошо видна. Как пример - скидываю 2 картинки из AIST на тему бутанола.
http://img403.imageshack.us/i/irccl4.gif/
http://img443.imageshack.us/i/irliq.gif/
Итог по эксперименту: на уширение влияет растворитель, межмолекулярное взаимодействие, фазовый состав и разрешение прибора

Что в теории: тут мы решаем задачу не о влиянии колебаний молекул на оптическую плотность излучения в ИК-области, а задачу о нахождении вторых частных производных энергии системы по координатам - и производные эти - есть одиночные числа, а не разброс. Поэтому сэмулировать мы сможем только положение максимума, и то, не забывая что речь идет об одной молекуле в вакууме. А вот ширину полосы никак не сэмулируешь (чтобы она опиралась на какую-то науку). Просто в просмотрщиках включена эта функция уширения для того, чтоб спектр сделать немного похожим на экспериментальный. Надо отдать должное авторам - для описания разброса используют функции Лоренца или сигма-функцию. Поэтому, иногда спектры получаются очень похожими.