IPB                

Здравствуйте, гость ( Вход | Регистрация )


ФорУм - для ума ©
БСЭ; DJVU Библиотека - Основное книгохранилище
Физическая теория живой клетки. Незамеченная революция, Новая книга
Vladimir Matveev
сообщение 22.08.2008, 11:33
Сообщение #1


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




В ноябре 2008 года выйдет в свет книга

Гильберт Линг
Физическая теория живой клетки
Незамеченная революция
Санкт-Петербург, "Наука"


Подробности см. здесь: _http://www.bioparadigma.spb.ru/russianling/russianling.htm


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
3 страниц V   1 2 3 >  
Начать новую тему
Ответов (1 - 24)
Vladimir Matveev
сообщение 31.08.2008, 10:17
Сообщение #2


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




Цитата(Vladimir Matveev @ 22.08.2008, 12:33) *
В ноябре 2008 года выйдет в свет книга

Гильберт Линг
Физическая теория живой клетки
Незамеченная революция
Санкт-Петербург, "Наука"


Подробности см. здесь: _http://www.bioparadigma.spb.ru/russianling/russianling.htm


Аннотация к книге

Все мы со школьной скамьи знаем, какую важную роль в жизни клетки играет мембрана. Автор книги считает, что ее роль во многом преувеличена и даже искажена. Барьерную функцию между клеткой и средой играет, согласно автору, структурированная вода, а не билипидный слой, покрывающий ее поверхность. Это свойство внутриклеточной воды не имеет ничего общего с некими «тайнами живой воды», ставшими предметом многочисленных спекуляций. В основе особого состояния воды в клетке лежит простое физическое явление: возрастание дипольного момента молекулы воды при взаимодействии с фиксированными зарядами на белках, в результате чего прочность водородных связей между молекулами возрастает, что и способствует появлению обширных и упорядоченных водных структур. Далее Линг утверждает, что молекулы белков являются электронными машинами. Благодаря изменению электронной плотности на функциональных группах белков изменяется характер их взаимодействия с водой, с ионами и другими веществами. В одном состоянии карбоксильные группы белков селективно связывают ионы K+, в другом — Na+. Главный вызов, который бросает Линг общепринятым представлениям — это утверждение, что теория натриевого насоса нарушает закон сохранения энергии. Его подсчеты показывают, что для поддержания наблюдаемого обмена ионами K+ и Na+ между клеткой и средой насосу требуется в несколько тысяч раз больше энергии, чем клетка способны произвести. В книге с новых позиций рассматриваются четыре фундаментальных свойства клетки: полупроницаемость, избирательность в поглощении веществ из среды, осмотическая стабильность и способность генерировать электрические потенциалы. Нет сомнения, что эта книга даст пищу для размышлений всем любознательным. Прав автор или нет, но одно бесспорно: его подход дает толчок активному переосмыслению самых разнообразных проблем биологии и физиологии клетки, включая азбучные истины. Книга рассчитана на студентов старших курсов, аспирантов и специалистов в области биофизики, биохимии и физиологии клетки.


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
mbikola
сообщение 31.08.2008, 10:33
Сообщение #3


Ректор
********

Группа: Supermoderator
Сообщений: 5893
Регистрация: 16.9.2006
Из: г. Одесса
Пользователь №: 2641
Поблагодарили: 4183 раз(а)




сайт-то не работает! (IMG:style_emoticons/default/wink.gif)


--------------------
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Vladimir Matveev
сообщение 1.09.2008, 8:39
Сообщение #4


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




Цитата(mbikola @ 31.08.2008, 11:33) *
сайт-то не работает! (IMG:style_emoticons/default/wink.gif)

РА-БО-ТА-ЕТ!!! (IMG:style_emoticons/default/total_sc.gif)


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Vladimir Matveev
сообщение 16.09.2008, 7:41
Сообщение #5


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




Поскольку свойства клеточной воды занимают в теории Линга важное место, предлагаю вниманию заинтересованных лиц полный текст книги "Water and the Cell" (Springer, 2006):

Front Matter.
PDF (85,2 KB) pp.I-IX
http://www.springerlink.com/content/j7534n/front-matter.pdf

Gilbert Ling. A Convergence of Experimental and Theoretical Breakthroughs Affirms the PM theory of Dynamically Structured Cell Water on the Theory’s 40th Birthday.
PDF (2,2 MB) pp.1-52
http://www.springerlink.com/content/lv3911...04/fulltext.pdf

Christine L. Haskin, Gary D. Fullerton and Ivan L. Cameron. Molecular Basis of Articular Disk Biomechanics: Fluid Flow and Water Content in the Temporomandibular Disk as Related to Distribution of Sulfur.
PDF (622,0 KB) pp. 53-70
http://www.springerlink.com/content/x52474...8v/fulltext.pdf

V.A. Shepherd. Coherent domains in the streaming cytoplasm of a giant algal cell.
PDF (789,0 KB) pp. 71-92
http://www.springerlink.com/content/t76v36...28/fulltext.pdf

S.E. Pagnotta and F. Bruni. The glassy state of water: A ‘stop and go’ device for biological processes.
PDF (403,9 KB) pp. 93-112
http://www.springerlink.com/content/h24514...16/fulltext.pdf

Martin F. Chaplin. Information Exchange within Intracellular Water.
PDF (368,2 KB) pp. 113-124
http://www.springerlink.com/content/u36242...14/fulltext.pdf

Dan Urry. Biology’s Unique Phase Transition Drives Cell Function.
PDF (2,8 MB) pp. 125-150
http://www.springerlink.com/content/m26272...tp/fulltext.pdf

Sinerik Ayrapetyan, Armine Amyan and Gayane Ayrapetyan. The Effects of Static Magnetic Fields, Low Frequency Electromagnetic Fields and Mechanical Vibration on some Physicochemical Properties of Water.
PDF (342,3 KB) pp. 151-164
http://www.springerlink.com/content/h6h477...63/fulltext.pdf

Jianming Zheng and Gerald Pollack. Solute Exclusion and Potential Distribution Near Hydrophilic Surfaces.
PDF (547,2 KB) pp. 165-174
http://www.springerlink.com/content/g4v52n...47/fulltext.pdf

W. Drost-Hansen. Vicinal Hydration of Biopolymers: Cell Biological Consequences.
PDF (842,5 KB) pp. 175-218
http://www.springerlink.com/content/x475n0...3t/fulltext.pdf

Mae-Wan Ho, Zhou Yu-Ming, Julian Haffegee, Andy Watton, Franco Musumeci, Giuseppe Privitera, Agata Scordino and Antonio Triglia. The Liquid Crystalline Organism and Biological Water.
PDF (664,5 KB) pp. 219-234
http://www.springerlink.com/content/pl0065...52/fulltext.pdf

Patricio Carvajal and Tyre Lanier. The Unfolded Protein State Revisited.
PDF (546,5 KB) pp. 235-252
http://www.springerlink.com/content/x570tk...52/fulltext.pdf

Frank Mayer, Denys Wheatley and Michael Hoppert. Some Properties of Interfacial Water: Determinants for Cell Architecture and Function?
PDF (4,3 MB) pp. 253-272
http://www.springerlink.com/content/pq3286...85/fulltext.pdf

Alexander Safronov, Tatyana Shklyar, Vadim Borodin, Yelena Smirnova, Sergey Sokolov, Gerald Pollack and Felix Blyakhman. Donnan Potential in Hydrogels of Poly(Methacrylic Acid) and its Potassium Salt.
PDF (165,9 KB) pp. 273-284
http://www.springerlink.com/content/k83440...u7/fulltext.pdf

Vladimir L. Voeikov. Biological Significance of Active Oxygen-Dependent Processes in Aqueous Systems.
PDF (121,7 KB) pp. 285-298
http://www.springerlink.com/content/k65454...3p/fulltext.pdf

Bohumil VybIral. The Comprehensive Experimental Research on the Autothixotropy of Water.
PDF (209,5 KB) pp. 299-314
http://www.springerlink.com/content/j43627...46/fulltext.pdf

Ivan Cameron and Gary Fullerton. Non-Bulk-Like Water on Cellular Interfaces.
PDF (266,0 KB) pp. 315-324
http://www.springerlink.com/content/g5r240...8n/fulltext.pdf

Yolene Thomas, Larbi Kahhak and Jamal Aissa. The physical nature of the biological signal, a puzzling phenomenon: the critical contribution of Jacques Benveniste.
PDF (300,2 KB) pp. 325-340
http://www.springerlink.com/content/q57x83...00/fulltext.pdf

Christine L. Haskin, Gary D. Fullerton and Ivan L. Cameron. Freezing, Flow and Proton NMR Properties of Water Compartments in the Temporomandibular Disc.
PDF (150,9 KB) pp. 341-352
http://www.springerlink.com/content/w35882...3q/fulltext.pdf

Back Matter.
PDF (38,2 KB)
http://www.springerlink.com/content/j7534n/back-matter.pdf


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Librarian
сообщение 18.09.2008, 5:51
Сообщение #6


Ректор
********

Группа: Member
Сообщений: 6257
Регистрация: 22.7.2005
Из: library
Пользователь №: 10
Поблагодарили: 1569 раз(а)




QUOTE (Vladimir Matveev @ 31.08.2008, 8:17) *
[ В основе особого состояния воды в клетке лежит простое физическое явление: возрастание дипольного момента молекулы воды при взаимодействии с фиксированными зарядами на белках, в результате чего прочность водородных связей между молекулами возрастает, что и способствует появлению обширных и упорядоченных водных структур.

а как вы оцениваете размер такого упорядочивания воды?
тут кстати была интересная работа

http://www.pnas.org/content/103/13/4846.abstract
Analysis of protein solvent interactions in glucose dehydrogenase from the extreme halophile Haloferax mediterranei



Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Vladimir Matveev
сообщение 18.09.2008, 6:55
Сообщение #7


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




Оценки такие: если на белках клетки адсорбируется от 6 слоев воды, этого достаточно, чтобы ВСЯ вода клетки оказалась структурированной (в силу высокой концентрации белков в клетке). Физическая природа возникновения многослойной структуры - в увеличении дипольного момента воды, вызванного ее взаимодействием с диполями полипептидной цепи (остова), группами С=0 и N-H. Молекулы с бОльшим дипольным моментом образуют более прочные водородные связи (прирост прочности 129 калорий/моль). Общий прирост прочности водородных связей нетрудно вычислить, зная что концентрация воды в клетке составляет 44 М. Увеличение поляризации диполей явление хорошо известное. Например, при конденсации воды из пара она возрастает. Поляризация молекул возрастает и при адсорбции на заряженных поверхностях.
Спасибо за интересную статью.


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Librarian
сообщение 19.09.2008, 0:58
Сообщение #8


Ректор
********

Группа: Member
Сообщений: 6257
Регистрация: 22.7.2005
Из: library
Пользователь №: 10
Поблагодарили: 1569 раз(а)




Эту статью я привел в пример потому что я очень хорошо знаю этот коллектив авторов и знаком с этими расчетами. Один из моих научных интересов, это анализ распределения водных слоев в белковых структурах.

пока в известных структурах больше двух упорядочненных слоев я особено не видел. Конечно кристаллы белков и живая клетка сильно разные объекты но общие тенденции должны соблюдаться или нет?


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Vladimir Matveev
сообщение 19.09.2008, 2:16
Сообщение #9


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




Librarian: "пока в известных структурах больше двух упорядочненных слоев я особено не видел. Конечно кристаллы белков и живая клетка сильно разные объекты но общие тенденции должны соблюдаться или нет"?
Matveev: думаю, нужно учитывать различие между белком в пробирке и в клетке. В клетке его концентрация на порядки выше и в этой безумной тесноте (crowding) и вода, и белки ведут себя несколько иначе. При сближении поверхностей белков их водные оболочки могут сливаться в более толстые образования из-за кооперативной природы адсорбированных слоёв. Кроме того, Линг в своей книге делает интересное наблюдение, которое обычно остается в тени. Он отмечает, что все оценки способности белков связывать воду делаются в условиях, когда давление водяного пара составляет всего 10-20% от ФИЗИОЛОГИЧЕСКОГО давления, которое имеет место в клетке. Отсюда и сильно заниженные оценки. При физиологических значениях давления пара, однако, процесс установления диффузионного равновесия между связанной и свободной водой растягивается на месяцы, что делает такие эксперименты практически неосуществимыми. В лаборатории Линга был разработан иной метод определения гидратации белков, отвечающий требованиям физиологичности, который дает оценки около 4 грамм воды на грамм белка. Причем речь идет не о глобулярных белках, гидрофобное ядро которых недоступно воде, а о белках с достаточно развернутой конформацией. О важном различии между этими двумя конформациями тоже нельзя забывать.


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Librarian
сообщение 20.09.2008, 15:43
Сообщение #10


Ректор
********

Группа: Member
Сообщений: 6257
Регистрация: 22.7.2005
Из: library
Пользователь №: 10
Поблагодарили: 1569 раз(а)




В расстворе конечно ситуация с концентрацией отличается от клеточной. Но вот в белковых кристаллах там концентрация белка очень высокая. объем белка к объему жидкости в кристалле колеблется от 2:1 до 1:2 (грубо оценивая).


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Vladimir Matveev
сообщение 20.09.2008, 20:17
Сообщение #11


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




Librarian: "В расстворе конечно ситуация с концентрацией отличается от клеточной. Но вот в белковых кристаллах там концентрация белка очень высокая. объем белка к объему жидкости в кристалле колеблется от 2:1 до 1:2 (грубо оценивая)".
Matveev: для клетки слишком мало: получается, что она только на 50% состоит из воды. А мы оч. хорошо знаем, что на 80%. А огурец, если верить некоторым, на все 90 - вода. (IMG:style_emoticons/default/smile.gif)


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
mbikola
сообщение 20.09.2008, 20:55
Сообщение #12


Ректор
********

Группа: Supermoderator
Сообщений: 5893
Регистрация: 16.9.2006
Из: г. Одесса
Пользователь №: 2641
Поблагодарили: 4183 раз(а)




Цитата(Vladimir Matveev @ 16.09.2008, 7:41) *
Поскольку свойства клеточной воды занимают в теории Линга важное место, предлагаю вниманию заинтересованных лиц полный текст книги "Water and the Cell" (Springer, 2006):

не кажется ли Вам, что Вы предлагаете не полный текст книги, а просто ее купить???
(IMG:style_emoticons/default/skonfuzen.gif)


--------------------
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Vladimir Matveev
сообщение 21.09.2008, 2:48
Сообщение #13


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




mbikola: "не кажется ли Вам, что Вы предлагаете не полный текст книги, а просто ее купить"???
Matveev: зачем покупать, если текст распространяется бесплатно?


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
mbikola
сообщение 21.09.2008, 3:26
Сообщение #14


Ректор
********

Группа: Supermoderator
Сообщений: 5893
Регистрация: 16.9.2006
Из: г. Одесса
Пользователь №: 2641
Поблагодарили: 4183 раз(а)




этот сайт лично у меня не работает ни в одном браузере, ни под одним IP:
Цитата


А шпрингер уж больно любит денажку:
Цитата
Front Matter.
PDF (85,2 KB) pp.I-IX
http://www.springerlink.com/content/j7534n/front-matter.pdf

Gilbert Ling. A Convergence of Experimental and Theoretical Breakthroughs Affirms the PM theory of Dynamically Structured Cell Water on the Theory’s 40th Birthday.
PDF (2,2 MB) pp.1-52
http://www.springerlink.com/content/lv3911...04/fulltext.pdf

Christine L. Haskin, Gary D. Fullerton and Ivan L. Cameron. Molecular Basis of Articular Disk Biomechanics: Fluid Flow and Water Content in the Temporomandibular Disk as Related to Distribution of Sulfur.
PDF (622,0 KB) pp. 53-70
http://www.springerlink.com/content/x52474...8v/fulltext.pdf

V.A. Shepherd. Coherent domains in the streaming cytoplasm of a giant algal cell.
PDF (789,0 KB) pp. 71-92
http://www.springerlink.com/content/t76v36...28/fulltext.pdf

S.E. Pagnotta and F. Bruni. The glassy state of water: A ‘stop and go’ device for biological processes.
PDF (403,9 KB) pp. 93-112
http://www.springerlink.com/content/h24514...16/fulltext.pdf

Martin F. Chaplin. Information Exchange within Intracellular Water.
PDF (368,2 KB) pp. 113-124
http://www.springerlink.com/content/u36242...14/fulltext.pdf

Dan Urry. Biology’s Unique Phase Transition Drives Cell Function.
PDF (2,8 MB) pp. 125-150
http://www.springerlink.com/content/m26272...tp/fulltext.pdf

Sinerik Ayrapetyan, Armine Amyan and Gayane Ayrapetyan. The Effects of Static Magnetic Fields, Low Frequency Electromagnetic Fields and Mechanical Vibration on some Physicochemical Properties of Water.
PDF (342,3 KB) pp. 151-164
http://www.springerlink.com/content/h6h477...63/fulltext.pdf

Jianming Zheng and Gerald Pollack. Solute Exclusion and Potential Distribution Near Hydrophilic Surfaces.
PDF (547,2 KB) pp. 165-174
http://www.springerlink.com/content/g4v52n...47/fulltext.pdf

W. Drost-Hansen. Vicinal Hydration of Biopolymers: Cell Biological Consequences.
PDF (842,5 KB) pp. 175-218
http://www.springerlink.com/content/x475n0...3t/fulltext.pdf

Mae-Wan Ho, Zhou Yu-Ming, Julian Haffegee, Andy Watton, Franco Musumeci, Giuseppe Privitera, Agata Scordino and Antonio Triglia. The Liquid Crystalline Organism and Biological Water.
PDF (664,5 KB) pp. 219-234
http://www.springerlink.com/content/pl0065...52/fulltext.pdf

Patricio Carvajal and Tyre Lanier. The Unfolded Protein State Revisited.
PDF (546,5 KB) pp. 235-252
http://www.springerlink.com/content/x570tk...52/fulltext.pdf

Frank Mayer, Denys Wheatley and Michael Hoppert. Some Properties of Interfacial Water: Determinants for Cell Architecture and Function?
PDF (4,3 MB) pp. 253-272
http://www.springerlink.com/content/pq3286...85/fulltext.pdf

Alexander Safronov, Tatyana Shklyar, Vadim Borodin, Yelena Smirnova, Sergey Sokolov, Gerald Pollack and Felix Blyakhman. Donnan Potential in Hydrogels of Poly(Methacrylic Acid) and its Potassium Salt.
PDF (165,9 KB) pp. 273-284
http://www.springerlink.com/content/k83440...u7/fulltext.pdf

Vladimir L. Voeikov. Biological Significance of Active Oxygen-Dependent Processes in Aqueous Systems.
PDF (121,7 KB) pp. 285-298
http://www.springerlink.com/content/k65454...3p/fulltext.pdf

Bohumil VybIral. The Comprehensive Experimental Research on the Autothixotropy of Water.
PDF (209,5 KB) pp. 299-314
http://www.springerlink.com/content/j43627...46/fulltext.pdf

Ivan Cameron and Gary Fullerton. Non-Bulk-Like Water on Cellular Interfaces.
PDF (266,0 KB) pp. 315-324
http://www.springerlink.com/content/g5r240...8n/fulltext.pdf

Yolene Thomas, Larbi Kahhak and Jamal Aissa. The physical nature of the biological signal, a puzzling phenomenon: the critical contribution of Jacques Benveniste.
PDF (300,2 KB) pp. 325-340
http://www.springerlink.com/content/q57x83...00/fulltext.pdf

Christine L. Haskin, Gary D. Fullerton and Ivan L. Cameron. Freezing, Flow and Proton NMR Properties of Water Compartments in the Temporomandibular Disc.
PDF (150,9 KB) pp. 341-352
http://www.springerlink.com/content/w35882...3q/fulltext.pdf

Back Matter.
PDF (38,2 KB)
http://www.springerlink.com/content/j7534n/back-matter.pdf


где бесплатно?


--------------------
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Librarian
сообщение 21.09.2008, 3:31
Сообщение #15


Ректор
********

Группа: Member
Сообщений: 6257
Регистрация: 22.7.2005
Из: library
Пользователь №: 10
Поблагодарили: 1569 раз(а)




Да согласен. Оригинал книги в формате DJVU присутствует на сайте, а русская версия скоро появится в продаже.


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
mbikola
сообщение 21.09.2008, 3:46
Сообщение #16


Ректор
********

Группа: Supermoderator
Сообщений: 5893
Регистрация: 16.9.2006
Из: г. Одесса
Пользователь №: 2641
Поблагодарили: 4183 раз(а)




ОК! поверю на слово, но даже прямая сылка на книгу у меня не пашет... (IMG:style_emoticons/default/sad.gif)


--------------------
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Librarian
сообщение 21.09.2008, 4:01
Сообщение #17


Ректор
********

Группа: Member
Сообщений: 6257
Регистрация: 22.7.2005
Из: library
Пользователь №: 10
Поблагодарили: 1569 раз(а)




Мне кажется данная тема очень интересной, и я попробую ее проанонсировать на сайте.
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Гость_Nils_*
сообщение 21.09.2008, 6:10
Сообщение #18





Guests







Цитата(mbikola @ 21.09.2008, 6:26) *
этот сайт лично у меня не работает ни в одном браузере, ни под одним IP:
Цитата



Сайт работает в полной мере!!!

mbikola, попробуй друго комп

Очень интересно, думаю многие читают... но пока вопросы не задают. Интересны масштабы упорядочивания.
Вопрос неспециалиста:

Слой воды - какой это масштаб и какой критерий служит мерой?

Спасибо.

Сообщение отредактировал Nils - 21.09.2008, 6:39
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Librarian
сообщение 21.09.2008, 6:31
Сообщение #19


Ректор
********

Группа: Member
Сообщений: 6257
Регистрация: 22.7.2005
Из: library
Пользователь №: 10
Поблагодарили: 1569 раз(а)




QUOTE (Nils @ 21.09.2008, 4:10) *
Слой воды - какой это масштаб и какой критерий служит мерой?

На сколько я понимаю разговор идет о молекулярных слоях. Кстати очень интересная каритна получается если построить количество (на самом деле плотность) упорядочненых молекул воды (те что большую часть времени занимают примерно одно и тоже положение в пространстве относительно белка) в зависимости от расстояния до белковой поверхности.
Если это строить на кристаллический структурах, то получается что то типа

protein surface here
.
.
*
**
************ <- пик
****
**
******* <- пик
**
*** <- пик
*


т.е. не больше трех пиков. Дальше затухание. Расстояния между пиваним соответсвуют водородным связям. В статье же говорится на сколько я понимаю о шести пиках как минимум.



Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Vladimir Matveev
сообщение 21.09.2008, 8:27
Сообщение #20


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




Nils: "Слой воды - какой это масштаб и какой критерий служит мерой"?
Matveev: в диализном мешке, заполненным концентрированным раствором гидрофильного полимера (поливиниловый спирт, например; концентрация 10-30%) ВСЯ вода модифицированна. Этот вывод делается на основе изучения РАВНОВЕСНОГО РАСПРЕДЕЛЕНИЯ веществ между мешком и средой, например Na+. Интересно, что кривые распределения (зависимость концентрации ВНУТРИ от концентрации СНАРУЖИ) принципиально совпадают у раствора полимера и живой клетки. А ПРИНЦИП состоит в том, что равновесная концентрация Na+ в мешке и в клетке ВСЕГДА меньше, чем в среде. Поскольку поливиниловый спирт не несет зарядов, остается одно объяснение: изменились свойства воды. Природа изменения в том, что под влиянием диполей линейного полимера, представляющего собой РЕГУЛЯРНУЮ структуру, молекулы воды адсорбируются в определенном порядке и ПОЛЯРИЗУЮТСЯ, то есть приобретают прибавку к собственному дипольному моменту. Этот момент принципиален для теории Линга, так как только благодаря поляризации первый слой связанной воды поляризует следующий; второй слой поляризует третий и т.д. В опытах Pollack'a (см. выше одну из глав шпрингеровской книги) показано, что слой организованной воды над поверхностью гидрофильного полимера может достигать миллиметров... Столь мощный эффект позволяет в перспективе создать опреснительную установку: соленая вода, текущая в капилляре, фракционируется: у стенок чистая структурированная вода, а чем ближе к оси капилляра, тем концентрированней соль, вытесняемая из фазы адсорбированной воды.

Что касается клетки, то концентрация белков в ней настолько велика (100-400 мг/мл), что оценки в 6 слоев воды оказывается достаточной, чтобы связанной оказалась ВСЯ внутриклеточная вода.

Белок (или иной полимер) хорошо связывает воду до тех пор, пока вся его полипептидная цепь или большая ее часть доступна воде. Если белок сворачивается в альфа-спираль, например, или его полипептидный остов "уходит" в гидрофобные ядра, домены, кластеры, то воде уже не с чем взаимодействовать и паракристаллическая водная структура разваливается. С клеткой это присходит при переходе ее в активное состояние, например, мышечная клетка сокращается, или при повреждении. Структурированная вода хуже растворяет тот же Na+ и этот катион, и другие вещества, устремляются из среды во внутриклеточное пространство.

О связанном состоянии клеточной воды свидетельствуют данные об ограниченной диффузии ее молекул, а самый известный метод, которым это показано, знают все. Это - магнитно-резонансная томография (МРТ).

Может быть эта ссылка будет работать: http://bioparadigma.narod.ru/russianling/russianling.htm

P.S. У меня почему-то не работает кнопка "Цитировать". Кроме того, на этом форуме нельзя, кажется, вставлять картинки...

Сообщение отредактировал Vladimir Matveev - 21.09.2008, 8:31


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Гость_Nils_*
сообщение 21.09.2008, 8:45
Сообщение #21





Guests







Цитата(Vladimir Matveev @ 21.09.2008, 11:27) *
P.S. У меня почему-то не работает кнопка "Цитировать". Кроме того, на этом форуме нельзя, кажется, вставлять картинки...

Если используете кнопку "цитировать", то после ее нажатия (выделяется цветом) нужно внизу темы нажать на большую кнопку "Ответить"

Либо можно использовать кнопку "ответить" на конкретном посте, тогда цитата поста, на который Вы отвечаете, вставиться автоматически.

Что касается фотографии и рисунков есть два способа:
1. во время создания поста загружаете файл-картинку (кнопкой "обзор" выбираете файл, потом нажмите "загрузить" и наконец во вкладке "управление файлами" нажмите первую иконку с подписью "вставить в пост...")
2. загрузите картинку на один из предназначенных для этого сайтов, например _http://imageshack.us/
там Вам дадут ссылку - эту ссылку Вы вставьте в пост с помощью иконки "Вставить изображение" на верхней панели во время создания поста

Сообщение отредактировал Nils - 21.09.2008, 8:50
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Vladimir Matveev
сообщение 21.09.2008, 9:01
Сообщение #22


Первокурсник
**

Группа: Member
Сообщений: 31
Регистрация: 28.2.2008
Из: Санкт-Петербург
Пользователь №: 6873
Поблагодарили: 24 раз(а)




Предлагаю для разнообразия вот такую картинку, на которой показано формирование многослойной водной структуры на поверхности гидрофильного полимера. Иллюстрация взята из книги: http://www.amazon.com/Cells-Gels-Engines-G...k/dp/0962689521 (покупать ее я ни в коем случае не предлагаю ввиду отсутствия соответствующего договора с амазоном). Впрочем, книга переведена на русский и распространяется в виде CD. Желающие приобрести этот диск могут обратиться к Виктору Мартынюку (mavis @ science-center.net). В июле за него просили 256 руб.

Эскизы прикрепленных изображений
Прикрепленное изображение
 


--------------------
Против методологического принуждения
http://www.bioparadigma.spb.ru


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
metelev_sv
сообщение 21.09.2008, 9:16
Сообщение #23


Профессор
*******

Группа: Moderator
Сообщений: 2698
Регистрация: 3.4.2008
Из: СПб
Пользователь №: 7086
Поблагодарили: 2348 раз(а)




Цитата(Vladimir Matveev @ 21.09.2008, 10:01) *
Предлагаю для разнообразия вот такую картинку, на которой показано формирование многослойной водной структуры на поверхности гидрофильного полимера.


Раз картинка приведена, нельзя ли её прокомментировать. Почему на начальном этапе на полимере нарисован только один "+", он что, по всей длине был положительно заряжен? Почему тогда молекулы воды начинают приклеиваться в шахматном порядке? Почему на финальной картинке тот же полимер изображён с чередованием "+" и "-", но чередование это не совпадает по периоду с чередованием молекул воды?


--------------------
Каждый раз, когда кто-то нажимает курок, чтобы исправить историческую ошибку, он лжет. Ибо история не делает ошибок, так как она не ставит никакой цели перед собой. Курок нажимает всегда тот, кто преследует свой личный интерес, а к истории он обращается, чтобы либо избежать ответственности, либо заглушить укоры совести.

Иосиф Бродский


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
Гость_Nils_*
сообщение 21.09.2008, 9:25
Сообщение #24





Guests







Цитата(Vladimir Matveev @ 21.09.2008, 12:01) *
Предлагаю для разнообразия вот такую картинку, на которой показано формирование многослойной водной структуры на поверхности гидрофильного полимера. Иллюстрация взята из книги: http://www.amazon.com/Cells-Gels-Engines-G...k/dp/0962689521 (покупать ее я ни в коем случае не предлагаю ввиду отсутствия соответствующего договора с амазоном). Впрочем, книга переведена на русский и распространяется в виде CD. Желающие приобрести этот диск могут обратиться к Виктору Мартынюку (mavis @ science-center.net). В июле за него просили 256 руб.

В дополнение к вопросам metelev_sv. А трехмерный случай картинки клетки можно?...

"слой воды" - это слой мономолекулярной толщины, как говорил Librarian... так?!

PS очень интересно про опреснители, только хотел написать, что такое переворот должен иметь последствия применимые на практике

Сообщение отредактировал Nils - 21.09.2008, 9:37
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение
mbikola
сообщение 21.09.2008, 14:58
Сообщение #25


Ректор
********

Группа: Supermoderator
Сообщений: 5893
Регистрация: 16.9.2006
Из: г. Одесса
Пользователь №: 2641
Поблагодарили: 4183 раз(а)




всем приношу свои извинения! Действительно работает все!
У меня какие-то траблы с ISP... (IMG:style_emoticons/default/sad.gif)


--------------------


Поблагодарили:
Перейти в начало страницы
+Цитировать сообщение

3 страниц V   1 2 3 >
Ответить в данную темуНачать новую тему
1 чел. читают эту тему (гостей: 1, скрытых пользователей: 0)
Пользователей: 0

 



Текстовая версия Сейчас: 4.09.2010, 3:40


Rambler's Top100